يقوم قسم البرامج بتحديد الاحتياجات اللازمة لتطوير واسناد عمل مديريات الحديقة بالاضافة الى الاحتياجات اللازمة لتحقيق الاهداف الاستراتيجية للحديقة لاستحداث برامج جديدة تعمل بتكامل مع مختلف مديريات الحديقة، حيث يقوم القسم بتحديد الاحتياجات والأولويات اللازمة لضمان تنفيذ الانشطة والمهمات المنوطة بالمديريات بفعالية. يقوم القسم ايضا بالاستجابة الى المتطلبات اللازمة الحالية والمستقبلية المتعلقة بتنفيذ الاهداف الاستراتيجية للحديقة لضمان تحقيق النتائج المثلى. يعمل القسم على جمع البيانات والمعلومات والوثائق والدراسات والمنشورات العلمية، بالاضافة الى المساهمة بإعداد الاستراتيجيات والسياسات الناظمة لانشطة المديريات لتحقيق معايير الاعتمادية المؤسسية للحديقة، كما يقوم القسم بفتح آفاق التعاون مابين الحديقة والمؤسسات الدولية والوطنية وتعزيز الشراكة فيما بينهما بمختلف المجالات التي تخدم الاهداف الوطنية والاستراتيجية للحديقة. كما يعمل القسم حاليا على ادارة برنامج اعادة تأهيل الغطاء النباتي بالتعاون مع المجتمع المحلي، كما تنوي الحديقة استحداث برنامج متخصص ببناء القدرات والتدريب لتعزيز القدرات الفنية لكادر الحديقة ولتدريب الكوادر الفنية من مختلف المؤسسات الملحلية والدولية.
برنامج اعادة تأهيل المراعي بالتعاون مع المجتمع المحلي (CBRR)